时光荏苒，岁月如梭，日本在秀保的治理下逐渐摆脱战争的阴霾，社会也慢慢步入正轨。难能可贵的是，石高达五百三十八万石的幕府将军，对仅拥有山城、河内、和泉、摄津四国百万石知行的丰臣宗家仍毕恭毕敬，四时觐见，臣下之礼未曾松懈，这让淀姬和秀赖宽心不少。

四年来，一些叱咤风云的大名、武将相继去世，从结城秀康到浅野长政，从细川藤孝到本多忠胜，让人无不感叹时代变迁，一个天下安定、百姓富足、远离战火的新时代正悄然到来。

这期间，秀保不断加强与各地大名的联系，特别是通过联姻，逐步将外样大名纳入自己的控制范围。

例如，将长女淘淘嫁给结城秀康之子结城忠直（水户藩五十三万五千石），将养女、谱代大名福井藩主那须资吉长女嫁给宇都宫义纲（宇都宫藩二十五万石），将养女、谱代大名三木藩主福岛高吉长女嫁给京极忠高（八上藩二十八万石），借此逐渐提升外样大名的忠诚度，巩固维护幕府的权威。

虽说风平浪静，但有件事倒是不得不提，便是庆长十年（1605年）八月，年仅十二周岁的丰臣秀赖正式晋升为从二位内大臣。

却因眼疾始终未能痊愈，性情也愈发暴戾顽劣，以至于有几次就连淀姬都险些被其砍伤，跟别说死在他刀下的无数侍从了。

坊间多称其为“杀生内府”，将他与当年的“杀生关白”丰臣秀次比较。他的所作所为让丰臣宗家的权威面临外界质疑，秀保多次遣人劝谏，甚至亲自前往劝说都难以见效。

淀姬看在眼里急在心里，多次召见石田三成上洛，亦是收效甚微，只能促请秀保遍寻名医尽最大可能治疗秀赖的眼疾。

庆长十二年（1607年）十月，织田秀信病逝，家中发生骚乱，庶长子刺杀嫡次子，恶行被家臣告之秀保，秀保大怒，将岐阜织田家改易，有功家臣收入秀保麾下，庶长子处死，领地纳入藏入地。

正逢丰臣秀贤年满十四岁，经过商议，秀保决定对除嫡子丰臣秀满外的四子进行分封。其中，

丰臣秀贤（长子，驹姬生）继承西近江三十六万石，居城坂本，史称“坂本藩”；

丰臣秀清（三子，樱姬生）继承中南伊势三十五万七千石，居城津，史称“津藩”；

丰臣秀兴（四子，阿江生）继承岐阜、岩村三十三万石，居城岐阜，史称“岐阜藩”；

丰臣秀虎（五子，菊姬生）继承南武藏三十三万石，居城江户，史称“江户藩”。

至此，秀保直领缩减至四百万石，不过四子尚且年幼，封地仍为秀保派人管理，侧室菊亭持子刚出生的孩子因年幼并未获封（一说秀保本意让其走公卿路线）。

这年十二月，年仅二十八岁的秀保在一众公家的簇拥下，顺利晋升从一位太政大臣，正式登上公家和武家的巅峰。